Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 401 ms