Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms