Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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