Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm6899Q3USS0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm6899Q3USS0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm6899Q3USS0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm6899Q3USS0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm6899Q3USS0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms