Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms