Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms