Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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D13Ertd608eQ3UPR8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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D13Ertd608eQ3UPR8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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D13Ertd608eQ3UPR8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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