Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms