Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms