Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf180Q3U827 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf180Q3U827 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf180Q3U827 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf180Q3U827 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf180Q3U827 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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