Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms