Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms