Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tmem35bQ3U0Y2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tmem35bQ3U0Y2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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