Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms