Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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