Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms