Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms