Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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RubcnlQ3TD16 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RubcnlQ3TD16 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RubcnlQ3TD16 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RubcnlQ3TD16 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RubcnlQ3TD16 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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RubcnlQ3TD16 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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RubcnlQ3TD16 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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