Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms