Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shroom4Q1W617 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms