Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Traf3ip1Q149C2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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