Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms