Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms