Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbln1Q08879 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms