Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms