Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AmbpQ07456 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms