Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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