Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms