Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cab39Q06138 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms