Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms