Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms