Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RykQ01887 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RykQ01887 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RykQ01887 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RykQ01887 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RykQ01887 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RykQ01887 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RykQ01887 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RykQ01887 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RykQ01887 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RykQ01887 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RykQ01887 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RykQ01887 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RykQ01887 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RykQ01887 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RykQ01887 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RykQ01887 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RykQ01887 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RykQ01887 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RykQ01887 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RykQ01887 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RykQ01887 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RykQ01887 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms