Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms