Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms