Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms