Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb4P99026 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Psmb4P99026 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1522 ms