Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms