Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tubg1P83887 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms