Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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