Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeboxP70368 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms