Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms