Protein–RNA interactions for Protein: P62754

Rps6, 40S ribosomal protein S6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6P62754 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps6P62754 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6P62754 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6P62754 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6P62754 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6P62754 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6P62754 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6P62754 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6P62754 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6P62754 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6P62754 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6P62754 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6P62754 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6P62754 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6P62754 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6P62754 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6P62754 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms