Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itga11P61622 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga11P61622 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms