Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nphp4P59240 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms