Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm9sf2P58021 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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