Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtnsP57757 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms