Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms