Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn18P56857 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn18P56857 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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