Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CartptP56388 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CartptP56388 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CartptP56388 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CartptP56388 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CartptP56388 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms