Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Faf1P54731 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Faf1P54731 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Faf1P54731 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Faf1P54731 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Faf1P54731 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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